Genome Project Solutions
Some of our scientists' publications on whole genome descriptions:
Price, D. C., C. X. Chan, H. S. Yoon, E. C. Yang, H. Qiu, A. P. M. Weber, R. Schwacke, J. Gross, N. Blouin, C. Lane, A. Reyes-Prieto, D. Dumford, J. Neilson, B. F. Lang, G. Burger, J. M. Steiner, W. Loffelhardt, J. E. Meuser, M. C. Posewitz, S. Ball, M. C. Arias, B. Henrissat, P. M. Coutinho, S. A. Rensing, A. Symeonidi, H. Doddapaneni, B. Green, V. D. Rajah, J. L. Boore and D. Bhattacharya, 2012 Cyanophora paradoxa genome elucidates origin of photosynthesis in algae and plants. Science 335: 843-847. Radakovits, R., R. E. Jinkerson, S. I. Fuerstenberg, H. Tae, R. E. Settlage, J. L. Boore and M. C. Posewitz, 2012 Draft genome sequence and genetic transformation of the oleaginous alga Nannochloropsis gaditana. Nature Communications 3: 686. Zhan, S., C. Merlin, J. L. Boore and S. M. Reppert, 2011 The monarch butterfly genome yields insights into long-distance migration. Cell 147: 1171-1185. Colbourne, J. K., M. E. Pfrender, D. Gilbert, W. K. Thomas, J.-H. Choi, A. Aerts, G Arnold, M. K. Basu, D. Bauer, C. Caceres, L. Carmel, P. Dehal, C. Detter, Q. Dong, S. Dusheyko, T. Frohlich, P. Hatcher, S. Jogdeo, J. Krijgsveld, D. Kueltz, C. Laforsch, E. Lindquist, J. Lopez, J. Manak, J. Muller, T. Oakley, J. Pangilinan, R. Patwardhan, S. Pitluck, E. Pritham, A. Rechtsteiner, M. Rho, I. Rogozin, O. Sakarya, A. Salamov, S. Schaack, H. Shapiro, Y. Shiga, C. Skalitzky, Z. Smith, A. Souvorov, W. Sung, Z. Tang, S.-I. Tokishita, D. Tsuchiya, H. Tu, A. Tucker, M. Wang, U. Wolf, H. Yamagata, T. Yanada, Y. Ye, J. Shaw, J. Andrews, T. Crease, H. Tang, S. Lucas, H. Robertson, P. Bork, E. Koonin, E. Zdobnov, I. Grigoriev, M. Lynch and J. L. Boore, 2011 The ecoresponsive genome of Daphnia pulex. Science 331: 555-561. Baxter, L., S. Tripathy, N. Ishaque, N. Boot, A. Cabral, E. Kemen, M. Thines, A. Ah-Fong, R. Anderson, W. Badejoko, P. Bittner-Eddy, J. L. Boore, M. C. Chibucos, M. Coates, P. Downton, P. Dehal, K. Delehaunty, S. Dong, B. Dumas, C. Fronick, S. I. Fuerstenberg, L. Fulton, E. Gaulin, F. Govers, L. Hughes, S. Humphrey, R. Jiang, H. Judelson, S. Kamoun, K. Kyung, H. Meijer, P. Minx, P. Morris, J. Nelson, V. Phuntumart, D. Qutob, A. Rehmany, P. Ryden, T. Torto-Alalibo, Y. Wang, J. Win, J. Wood, S. W. Clifton, J. Rogers, G. Van den Ackerveken, J. D. G. Jones, J. M. McDowell, J. Beynon and B. M. Tyler, 2010 Signatures of adaptation to obligate biotrophy in the Hyaloperonospora arabidopsidis genome. Science 330: 1549-1551. Lévesque, C. A., H. Brouwer, L. Cano, J. P. Hamilton, C. Holt, E. Huitema, S. Raffaele, G. P. Robideau, M. Thines, J. Win, M. M. Zerillo, G. W. Beakes, J. L. Boore, D. Busam, B. Dumas, S. Ferriera, S. I. Fuerstenberg, C. M. M. Gachon, E. Gaulin, F. Govers, L. Grenville-Briggs, N. Horner, J. Hostetler, R. H. Y. Jiang, J. Johnson, T. Krajaejun, H. Lin, H. J. G. Meijer, B. Moore, P. Morris, V. Phuntmart, D. Puiu, J. Shetty, J. E. Stajich, S. Tripathy, S. Wawra, P. van West, B. R. Whitty, P. M. Coutinho, B. Henrissat, F. Martin, P. D. Thomas, B. M. Tyler, R. P. De Vries, S. Kamoun, M. Yandell, N. Tisserat and C. R. Buell, 2010 Genome sequence of the necrotrophic plant pathogen, Pythium ultimum, reveals original pathogenicity mechanisms and effector repertoire. Genome Biology 11: R73. Rensing, S. A., D. Lang, A. Zimmer, A. Terry, A. Salamov, H, Shapiro, T. Nishiyama, P.-F. Perroud, E. Lindquist, Y. Kamisugi, T. Tanahashi, K. Sakakibara, T. Fujita, K. Oishi, T. Shin-I, Y. Kuroki, A. Toyoda, Y. Suzuki, S.-I. Hashimoto, K. Yamaguchi, S. Sugano, Y. Kohara, A. Fujiyama, N. Ashton, A. Anterola, S. Aoki, W. B. Barbazuk, E. Barker, J. Bennetzen, R. Blankenship, S. H. Cho, S. Dutcher, M. Estelle, J. A. Fawcett, H. Gundlach, K. Hanada, A. Heyl, K. A. Hicks, J. Hughes, M. Lohr, K. Mayer, A. Melkozernov, T. Murata, D. Nelson, B. Pils, M. Prigge, B. Reiss, T. Renner, S. Rombauts, P. Rushton, A. Sanderfoot, G. Schween, S.-H. Shiu, K. Stueber, F. L. Theodoulou, H. Tu, Y. Van de Peer, P. J. Verrier, E. Waters, A. Wood, L. Yang, D. Cove, A. C. Cuming, M. Hasebe, S. Lucas, B. D. Mishler, R. Reski, I. Grigoriev, R. S. Quatrano and J. L. Boore, 2008 The genome of the moss Physcomitrella patens reveals evolutionary insights into the conquest of land by plants. Science 319: 64-69. Tyler, B. M., S. Tripathi, X. Zhang, P. Dehal, R. Jiang, A. Aerts, F. D. Arredondo, L. Baxter, D. Bensasson, J. Beynon, J. Chapman, C. M. B. Damasceno, A. E. Dorrance, D. Dou, A. W. Dickerman, I. Dubchak, M. Garbelotto, M. Gijzen, S. G. Gordon, F. Govers, N. J. Grunwald, W. Huang, K. Ivors, R. W. Jones, S. Kamoun, K. Krampis, K. Lamour, M. –K. Lee, W. H. McDonald, M. Medina, H. J. G. Meijer, E. K. Nordberg, D. J. Maclean, M. D. Ospina-Giraldo, P. Morris, V. Phuntumart, N. Putnam, S. Rash, J. K. C. Rose, Y. Sakihama, A. Salamov, A. Savidor, C. F. Scheuring, B. M. Smith, B. W. S. Sobral, A. Terry, T. A. Torto-Alalibo, J. Win, Z. Xu, H. Zhang, I. Grigoriev, D. Rokhsar and J. L. Boore, 2006 Phytophthora genome sequences uncover evolutionary origins and mechanisms of pathogenesis. Science 313: 1261-1266.
Dehal, P., Y. Satou, R. Campbell, J. Chapman, B. Degnan, A. DeTomaso, B. Davidson, A. DiGregorio, M. Gelpke, D. Goodstein, N. Harafuji, K. Hastings, I. Ho, K. Hotta, W. Huang, T. Kawashima, P. Lemaire, D. Martinez, I. Meinertzhagen, S. Necula, M. Nonaka, N. Putnam, S. Rash, H. Saiga, M. Satake, A. Terry, L. Yamada, H.-G. Wang, S. Awazu, K. Azumi, J. L. Boore, M. Branno, S. Chin-bow, R. DeSantis, S. Doyle, P. Francino, D. Keys, S. Haga, H. Hayashi, K. Hino, K. Imai, K. Inaba, S. Kano, K. Kobayashi, M. Kobayashi, B.-I. Lee, K. Makabe, C. Manohar, G. Matassi, M. Medina, Y. Mochizuki, S. Mount, T. Morishita, S. Miura, A. Nakayama, S. Nishizaka, H. Nomoto, F. Ohta, K. Oishi, I. Rigoutsos, M. Sano, A. Sasaki, Y. Sasakura, E. Shoguchi, T. Sin-I, A. Spagnuolo, D. Stainier, M. Suzuki, O. Tassy, N. Takatori, M. Tokuoka, K. Yagi, F. Yoshizaki, S. Wada, C. Zhang, P. D. Hyatt, F. Larimer, C. Detter, N. Doggett, T. Glavina, T. Hawkins, P. Richardson, S. Lucas, Y. Kohara, M. Levine, N. Satoh and D. Rokhsar, 2002 The draft Genome of Ciona intestinalis: Insights into chordate and vertebrate origins. Science 298: 2157-2167.
BACK to the Publications Overview page
